Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC172P0C7W6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms