Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CSF3P09919 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSF3P09919 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSF3P09919 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSF3P09919 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3P09919 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3P09919 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms