Protein–RNA interactions for Protein: P04433

IGKV3-11, Immunoglobulin kappa variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-11P04433 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKV3-11P04433 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms