Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSD2O96028 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSD2O96028 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSD2O96028 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSD2O96028 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSD2O96028 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSD2O96028 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSD2O96028 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSD2O96028 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSD2O96028 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSD2O96028 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSD2O96028 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSD2O96028 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSD2O96028 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSD2O96028 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSD2O96028 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSD2O96028 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSD2O96028 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSD2O96028 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSD2O96028 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSD2O96028 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSD2O96028 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSD2O96028 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSD2O96028 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSD2O96028 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSD2O96028 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSD2O96028 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSD2O96028 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSD2O96028 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NSD2O96028 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSD2O96028 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NSD2O96028 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSD2O96028 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSD2O96028 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSD2O96028 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSD2O96028 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSD2O96028 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSD2O96028 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NSD2O96028 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSD2O96028 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSD2O96028 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSD2O96028 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSD2O96028 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSD2O96028 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSD2O96028 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSD2O96028 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSD2O96028 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSD2O96028 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSD2O96028 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NSD2O96028 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSD2O96028 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSD2O96028 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSD2O96028 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NSD2O96028 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSD2O96028 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NSD2O96028 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSD2O96028 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSD2O96028 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSD2O96028 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSD2O96028 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSD2O96028 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSD2O96028 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSD2O96028 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSD2O96028 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSD2O96028 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSD2O96028 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSD2O96028 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSD2O96028 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSD2O96028 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSD2O96028 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSD2O96028 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSD2O96028 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSD2O96028 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSD2O96028 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSD2O96028 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSD2O96028 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSD2O96028 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NSD2O96028 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NSD2O96028 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSD2O96028 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSD2O96028 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSD2O96028 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSD2O96028 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSD2O96028 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSD2O96028 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSD2O96028 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSD2O96028 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSD2O96028 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSD2O96028 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSD2O96028 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSD2O96028 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSD2O96028 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSD2O96028 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSD2O96028 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSD2O96028 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSD2O96028 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NSD2O96028 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NSD2O96028 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NSD2O96028 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NSD2O96028 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms