Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POP4O95707 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POP4O95707 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POP4O95707 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POP4O95707 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POP4O95707 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POP4O95707 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POP4O95707 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POP4O95707 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POP4O95707 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POP4O95707 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POP4O95707 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POP4O95707 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POP4O95707 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POP4O95707 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POP4O95707 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POP4O95707 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POP4O95707 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POP4O95707 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POP4O95707 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POP4O95707 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POP4O95707 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POP4O95707 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POP4O95707 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POP4O95707 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POP4O95707 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POP4O95707 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POP4O95707 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POP4O95707 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POP4O95707 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POP4O95707 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POP4O95707 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POP4O95707 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POP4O95707 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POP4O95707 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POP4O95707 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POP4O95707 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POP4O95707 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POP4O95707 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POP4O95707 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POP4O95707 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POP4O95707 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POP4O95707 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POP4O95707 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POP4O95707 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POP4O95707 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POP4O95707 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POP4O95707 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POP4O95707 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POP4O95707 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POP4O95707 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POP4O95707 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POP4O95707 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POP4O95707 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POP4O95707 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POP4O95707 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POP4O95707 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POP4O95707 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms