Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATE1O95260 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATE1O95260 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATE1O95260 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATE1O95260 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATE1O95260 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATE1O95260 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATE1O95260 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATE1O95260 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATE1O95260 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATE1O95260 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATE1O95260 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATE1O95260 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATE1O95260 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATE1O95260 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATE1O95260 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATE1O95260 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATE1O95260 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms