Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEBLO76041 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEBLO76041 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms