Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTIPO60759 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms