Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB3O43889 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB3O43889 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB3O43889 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB3O43889 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3O43889 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3O43889 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3O43889 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3O43889 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3O43889 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3O43889 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3O43889 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3O43889 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3O43889 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3O43889 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3O43889 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3O43889 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3O43889 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3O43889 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3O43889 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3O43889 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3O43889 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3O43889 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3O43889 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3O43889 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3O43889 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB3O43889 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB3O43889 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB3O43889 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB3O43889 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB3O43889 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB3O43889 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB3O43889 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB3O43889 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB3O43889 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB3O43889 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB3O43889 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB3O43889 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB3O43889 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB3O43889 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB3O43889 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB3O43889 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB3O43889 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB3O43889 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB3O43889 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB3O43889 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB3O43889 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB3O43889 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB3O43889 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB3O43889 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB3O43889 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB3O43889 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms