Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALUO43852 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALUO43852 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALUO43852 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CALUO43852 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CALUO43852 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CALUO43852 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALUO43852 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALUO43852 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALUO43852 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALUO43852 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALUO43852 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALUO43852 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALUO43852 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALUO43852 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALUO43852 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALUO43852 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALUO43852 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALUO43852 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALUO43852 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALUO43852 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALUO43852 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALUO43852 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALUO43852 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALUO43852 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALUO43852 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALUO43852 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALUO43852 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALUO43852 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALUO43852 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALUO43852 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALUO43852 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALUO43852 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALUO43852 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALUO43852 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALUO43852 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALUO43852 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALUO43852 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALUO43852 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALUO43852 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALUO43852 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALUO43852 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALUO43852 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALUO43852 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALUO43852 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALUO43852 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALUO43852 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALUO43852 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALUO43852 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALUO43852 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALUO43852 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALUO43852 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CALUO43852 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALUO43852 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CALUO43852 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CALUO43852 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALUO43852 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALUO43852 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALUO43852 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALUO43852 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALUO43852 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALUO43852 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALUO43852 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALUO43852 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALUO43852 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALUO43852 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALUO43852 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALUO43852 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALUO43852 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALUO43852 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALUO43852 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CALUO43852 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALUO43852 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALUO43852 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALUO43852 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CALUO43852 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALUO43852 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALUO43852 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALUO43852 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALUO43852 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CALUO43852 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALUO43852 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALUO43852 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALUO43852 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALUO43852 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALUO43852 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALUO43852 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALUO43852 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALUO43852 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALUO43852 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CALUO43852 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CALUO43852 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CALUO43852 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CALUO43852 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CALUO43852 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CALUO43852 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CALUO43852 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CALUO43852 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CALUO43852 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CALUO43852 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms