Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PRKAB2O43741 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKAB2O43741 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKAB2O43741 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKAB2O43741 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKAB2O43741 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms