Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UBDO15205 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UBDO15205 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBDO15205 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UBDO15205 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBDO15205 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBDO15205 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBDO15205 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBDO15205 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBDO15205 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBDO15205 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBDO15205 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBDO15205 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBDO15205 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBDO15205 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBDO15205 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBDO15205 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBDO15205 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBDO15205 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBDO15205 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBDO15205 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBDO15205 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBDO15205 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBDO15205 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBDO15205 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBDO15205 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBDO15205 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBDO15205 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBDO15205 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBDO15205 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBDO15205 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBDO15205 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBDO15205 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBDO15205 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBDO15205 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBDO15205 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBDO15205 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBDO15205 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBDO15205 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBDO15205 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBDO15205 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBDO15205 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBDO15205 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBDO15205 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBDO15205 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBDO15205 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBDO15205 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBDO15205 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBDO15205 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBDO15205 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBDO15205 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBDO15205 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms