Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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