Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms