Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms