Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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C4orf47A7E2U8 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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C4orf47A7E2U8 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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C4orf47A7E2U8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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C4orf47A7E2U8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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