Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms