Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms