Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms