Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms