Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms