Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC162PA2VCL2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms