Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms