Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms