Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG6Q9Y2V7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms