Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERGIC3Q9Y282 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms