Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZRN3Q9UPQ7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZRN3Q9UPQ7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZRN3Q9UPQ7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZRN3Q9UPQ7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZRN3Q9UPQ7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZRN3Q9UPQ7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZRN3Q9UPQ7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZRN3Q9UPQ7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms