Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FZD4Q9ULV1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms