Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms