Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms