Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MBD1Q9UIS9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MBD1Q9UIS9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MBD1Q9UIS9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
MBD1Q9UIS9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MBD1Q9UIS9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
MBD1Q9UIS9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms