Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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