Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms