Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms