Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGSF9Q9P2J2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGSF9Q9P2J2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9Q9P2J2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9Q9P2J2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9Q9P2J2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9Q9P2J2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9Q9P2J2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9Q9P2J2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9Q9P2J2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9Q9P2J2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9Q9P2J2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9Q9P2J2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9Q9P2J2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9Q9P2J2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9Q9P2J2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9Q9P2J2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9Q9P2J2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9Q9P2J2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9Q9P2J2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9Q9P2J2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGSF9Q9P2J2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms