Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms