Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms