Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms