Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0M6

H2AFY2, Core histone macro-H2A.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFY2Q9P0M6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms