Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms