Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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RDH8Q9NYR8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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RDH8Q9NYR8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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RDH8Q9NYR8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RDH8Q9NYR8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RDH8Q9NYR8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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