Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA1

SPHK1, Sphingosine kinase 1, humanhuman

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Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1Q9NYA1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPHK1Q9NYA1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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