Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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