Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms