Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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