Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NTN4Q9HB63 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms