Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms