Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms