Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms