Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.64
KDM5DQ9BY66 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms